우선 영업 손실을 '100%'가 아닌 '80%'만 보상한다는 것에 대해 유감을 표시하고 있다. 소상공인연합회는 정부 발표 이후 논평을 내고 "온전한 손실보상과는 차이가 있는 '80%' 손실보상안에 실망을 감출 수 없다"며 "20%를 깎은 부분은 결국 소상공인에게 충분하지 못한 보상으로 비춰질 것"으로 전망했다. 소공연 차남수 정책홍보본부장은 "100% 보상도 아닌데 여기에 보상 상한액까지 둔 것 역시 '온전한 손실보상'과는 거리가 있는 것"이라고 말했다.
전국자영업자비상대책위원회(자대위)와 한국중소상인자영업자총연합회(한상총련)도 100% 보상에 미치지 못해 아쉽다는 반응을 보였다.
그러나 영업제한 업종의 보상률을 당초 60%에서 집합금지 업종과 동일한 80%로 끌어올린 것에 대해서는 긍정 평가했다. 조지현 자대위 공동대표는 "우리의 기본 입장은 100% 보상이지만 그래도 영업제한 업종의 보상을 80%까지 올린 부분에 대해서는 환영한다"고 말했다. 이성원 한상총련 사무총장 역시 "집합금지 업종과 영업제한 업종에 차등을 두지 않은 것과 임차료, 인건비를 다 보상하도록 한 것은 환영할만하다"고 밝혔다.
정부의 손실보상안에 대한 소상공인 자영업자들의 첫 반응이 나쁘지 않지만 막상 손실보상에 들어가면 얘기는 달라질 수 있다. 이성원 한상총련 사무총장은 "손실보상이 지급되기 시작하면 정부가 산출한 손실보상금을 놓고 '이의신청'이 잇따를 수 있다"며 "(정확한 평가를 위해서는) 이제부터 시뮬레이션을 해봐야 한다"고 밝혔다. 차남수 소공연 본부장도 "개인적으로 시뮬레이션을 해본 결과 매출액이 떨어질수록 보상금도 작아지는 경우도 나온다"며 "상황을 좀 더 살펴봐야 한다"고 말했다.